El coquí de la montaña es bien parecido al coquí común ya que su voz es "co-quí" y los patrones dorsales son variables también. De hecho, hasta el 1966 el coquí común y el de la montaña se confundían en la misma especie, E. portoricensis.
Este coquí solamente vive en las montañas. Al igual que las demás especies, las hembras son más grandes que los machos, 35 mm (1.4") y 30 mm (1.2") respectivamente.
Esta especie se puede diferenciar del coquí común por su voz, el color de los ojos y patrones en el abdomen. La voz del coquí de la montaña es más rápida y aguda que la del coquí común en elevaciones altas. Otra característica de este coquí es que la parte superior de los ojos es de color blanco. El abdomen también tiende a ser blanco, a veces con líneas o manchas negras.